網站源碼是否存在惡意修改的木馬，這個一般是比較難檢查到的。現在很多爆破後臺或者ftp的黑客工具，拿到網站權限之後，會植入黑鏈或者木馬程序，表面上看是不會有任何問題的，所以需要對源碼進行殺毒和源碼修改比對，查看源碼近期被修改了哪些文件，覈對是否是自己修改的。
檢查網站是否存在外部因素影響，這個主要是指域名泛解析和批量惡意外鏈，域名泛解析的問題還算比較好處裏，這裏有分享過一篇關於“域名被惡意泛解析了怎辦”的文章，可以簡單處理，因爲暫時百度沒有更好的辦法解決這一問題;批量惡意外鏈，需要在站長工具查看外鏈信息，是否出現暴增或者涉及黃賭毒的外鏈，處理掉就可以了。
另外一個很重要的影響網站的因素，那就是友情鏈接。因爲友情鏈接就是相當於“網站投票”，是一種信任的網絡投票，當你的友鏈出現K站或者長期無法訪問，你的網站必然會受到或多或少的懲罰，而
BOB集团有限公司科技經過檢查發現，其中有5個友鏈出現了問題，這真是不大不小的問題，包括域名過期、無法訪問和K站，所以網站排名不掉都是很難的一件事，而且網站所在服務器最近一週並不穩定，網站綜合評分出現大幅度下滑，甚至部分關鍵詞排名出現短暫的跌至百名之外，排名下降是必然的結果。
